Исторически диссертационный совет при Федеральном научном центре овощеводства, ранее – Всесоюзном ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательском институте селекции и семеноводства овощных культур (ВНИИССОК), существует более 45 лет. Для повышения квалификации научных кадров в 1976 году при ВНИИССОК был создан специализированный совет по защите диссертаций на соискание учёной степени доктора наук Д-1154 по сельскохозяйственным наукам по специальности 06.01.05 – селекция и семеноводство овощных культур, в количестве 16 докторов наук, из них 6 докторов биологических наук и 9 докторов сельскохозяйственных наук (приказ Председателя ВАК при Совете Министров СССР от 19 марта 1976 г. № 355-в). Председателем спецсовета назначен академик ВАСХНИЛ, директор ВНИИССОК Павел Федорович Сокол.
В 1980 году специализированному совету при ВНИИССОК приказом Председателя ВАК при Совете Министров СССР (приказ от 12 мая 1980 г. № 209-в) было разрешено принимать к защите диссертации на соискание ученой степени доктора наук по двум специальностям: 06.01.05 – селекция и семеноводство (полевых, включая кормовые, плодовых и овощных культур); 06.01.06 – овощеводство. Шифр совета был обновлен – Д 120.11.01, и состав увеличился до 19 человек (13 – докторов с.-х. наук, 6 – докторов биол. наук).
На основании Положения о порядке присуждения ученых степеней и присвоения ученых званий 1975 года, специализированные советы по защите докторских диссертаций могли принимать к защите диссертации на соискание ученой степени кандидата наук. С марта 1976 года по май 1985 года в специализированном совете при ВНИИССОК было защищено 11 докторских и 10 кандидатских диссертаций.
В 1982 году в связи с изменением ведомственной принадлежности специализированный совет Д 120.11.01 при ВНИИССОК был переименован в специализированный совет Д 159.01.01 при Всесоюзном научно-исследовательском институте селекции и семеноводства овощных культур при Министерстве плодоовощного хозяйства СССР (приказ ВАК при Совете Министров СССР от 1 декабря 1982 г. № 804/209), под председательством П.Ф. Сокола, а с 1986 года, в связи с уходом его на заслуженный отдых, председателем докторского спецсовета назначен новый директор ВНИИССОК Сергей Иванович Сычев.
В связи с расширением сферы деятельности института и организацией новых крупных отделов (семеноводства, семеноведения, технологии механизированного возделывания семян овощных культур, оценки качества сортов овощных культур при хранении) и возросшей нагрузкой по подготовке высоквалифицированных кадров для отрасли овощеводства, в 1982 году при ВНИИССОК создан специализированный совет по защите кандидатских диссертаций К159.01.01 (приказ ВАК СССР от 24 ноября 1982 г. № 584-в). В состав совета включены 16 ведущих учёных, в том числе 8 кандидатов наук, председателем совета назначен заместитель директора по научной работе Алексей Павлович Примак, а с 1985 года – Виктор Фёдорович Пивоваров.
За весь срок полномочий советами проводилась значительная работа: 1982 по 1990 годы в советы поступили 82 диссертации, защищено с положительным решение совета 65 диссертаций.
В 1990 году приказом ВАК при Совете Министров СССР (приказ от 14 декабря 1990 г. № 1024-в) утвержден новый состав и изменен шифр совета по защите диссертаций на соискание учёной степени кандидата наук во Всесоюзном ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательском институте селекции и семеноводства овощных культур К 120.89.01, под председательством В.Ф. Пивоварова, численность специализированного совета составила 17 человек. С 1991 по 2000 годы в совете защищено 74 диссертации.
Подготовка высококвалифицированных кадров всегда являлась важным аспектом деятельности ВНИИССОК. В 2001 году по инициативе В.Ф. Пивоварова организована докторантура и приказом ВАК Минобрнауки России (приказ от 9 февраля 2001 г. № 461-в) открыт совет по защите докторских и кандидатских диссертаций Д 220.019.01 (в составе 18 человек) по сельскохозяйственным наукам по специальностям: 06.01.05 – селекция и семеноводство; 06.01.06 – овощеводство. За последующие 10 лет работы в диссовете защищены 11 докторских диссертаций и 78 кандидатских диссертаций.
В 2010 году в перечень специальностей, по которым диссертационному совету Д 220.019.01 разрешено проводить защиту диссертаций на соискание ученой степени доктора и кандидата наук включены специальности: 06.01.01 – общее земледелие; 06.01.07 – защита растений. Состав совета насчитывал 22 человека, из них 15 докторов с.-х. наук, 6 докторов биол. наук, 1 доктор эконом. наук (приказ Рособрнадзора Минобрнауки России от 14 мая 2010 г. № 1030-371).
В 2013 году в связи со сменой номенклатуры научных специальностей диссовет переутвержден (приказ ВАК Минобрнауки России от 1 апреля 2013 г. № 156/нк) по специальностям: 06.01.05 – селекция и семеноводство; 06.01.07 – защита растений; 06.01.09 – овощеводство.
В 2017 году после реорганизации ФГБНУ ВНИИССОК в форме присоединения к нему семи учреждений науки, диссертационный совет Д 220.019.01 сохранил свою деятельность уже при вновь созданном Федеральном научном центре овощеводства (ФГБНУ ФНЦО).
С 17 мая 2018 года на базе Федерального научного центра овощеводства создан совет по защите диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук, на соискание ученой степени доктора наук Д 220.019.02 по научным специальностям: 06.01.05 – селекция и семеноводство сельскохозяйственных растений (с.-х. науки); 06.01.09 – овощеводство (с.-х. науки), объединивший в своем составе 24 ведущих специалиста бывшего ВНИИССОК и Всероссийского научно-исследовательского института овощеводства (ВНИИО), ставшего в 2017 г. филиалом ФГБНУ ФНЦО, а также специалистов других научных учреждений и вузов (приказ Минобрнауки России от 12 апреля 2018 г. № 400/нк). Председателем диссовета является академик РАН В.Ф. Пивоваров, заместителем председателя назначен избранный директором Центра доктор сельскохозяйственных наук Алексей Васильевич Солдатенко. Совет действовал до конца 2022 года.
С 2013 по 2022 годы в диссовете защищены 9 докторских диссертаций и 51 кандидатская диссертация.
В соответствии с приказом Министерства науки и высшего образования Российской Федерации № 1819/нк от 26 сентября 2023 г. на базе Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный научный центр овощеводства» (ФГБНУ ФНЦО) в связи с изменением шифра научных специальностей создан и начинает работу совет по защите диссертаций на соискание учёной степени кандидата наук, на соискание учёной степени доктора наук 24.1.256.01 по научной специальности: 4.1.2. – Селекция, семеноводство и биотехнология растений (сельскохозяйственные науки) под председательством академика РАН В.Ф. Пивоварова, заместитель председателя – академик РАН А.В. Солдатенко.
Долгое время ВНИИССОК осуществлял координацию и научно-методическое руководство по селекции и семеноводству овощных культур 45 научно-исследовательскими учреждениями и кафедрами ВУЗов. В настоящее время ФГБНУ ФНЦО является головным учреждением в стране по этим вопросам и ведёт подготовку научных кадров в этом направлении. Помимо собственных выпускников аспирантуры и докторантуры в диссертационном совете в разные годы проходили защиту работ кандидаты и доктора наук не только из России, но и из стран ближнего и дальнего зарубежья (Украина, Молдавия, Азербайджан, Туркменистан, Узбекистан, Куба, Сирия, Иран, Ирак, Кения, Йемен, Египет и др.). Всего за 47 лет существования диссертационного совета в нашей организации защитили диссертации более 300 человек, из них 31 докторская диссертации и 278 кандидатских работ.