Селекционно-семеноводческий центр создан в 2004 году, объединяет отделы и лаборатории института по селекции и первичному семеноводству овощных, бахчевых и цветочных культур. В задачу селекционно-семеноводческого центра входит создание новых высококачественных, конкурентоспособных сортов и гибридов F1 овощных, бахчевых, пряно-вкусовых и цветочных культур с комплексной устойчивостью к биотическим и абиотическим факторам среды; ведение первичного и товарного семеноводства в ассортименте и объемах, удовлетворяющих спрос на семена овощных и цветочных культур селекции ВНИИССОК.
Лаборатории селекции и семеноводства:
Лаборатория селекция и семеноводства бобовых культур
Лаборатория селекции и семеноводства зеленных, пряно-вкусовых и цветочных культур
Лаборатория селекции и семеноводства капустных культур
Лаборатория селекции и семеноводства столовых корнеплодов
Лаборатория селекции и семеноводства луковых культур
Лаборатория селекции и семеноводства тыквенных культур
Лаборатория селекции и семеноводства пасленовых культур
Опытная сеть